Родился 26 ноября 1946 г. в Ленинграде. Обучался в Дальневосточном политехническом институте, а затем в Ленинградском кораблестроительном институте (ЛКИ) по специальности «Судовые силовые установки». После окончания ЛКИ работал на судостроительном заводе «Северная верфь» старшим мастером. В 1975 г. М. Ю. Алехин начал преподавательскую деятельность на кафедре управления судостроительным производством (УСП) СПбГМТУ по специальности «Экономика и управление на предприятии машиностроения».

Защитил кандидатскую и докторскую диссертации, стал профессором, заведующим кафедрой и деканом экономического факультета СПбГМТУ.

Сфера научных интересов М. Ю. Алехина: инвестиционный анализ, оценка бизнеса и его инвестиционной привлекательности, управление промышленным предприятием, структурный анализ.

Автор более 100 научных работ, учебных пособий и монографий. Под его руководством защищены 6 кандидатских диссертаций.

Является председателем Ученого совета экономического факультета СПбГМТУ. Председатель диссертационного совета по присуждению ученых степеней доктора и кандидата экономических наук по специальности 08.00.05 — «Экономика и управление народным хозяйством (экономика, организация и управление предприятиями, отраслями, комплексами — промышленность)» (1997).

Руководитель секции «Экономика и управление» Российского научно-технического общества судостроителей им. акад. А. Н. Крылова (с 2005). Под его руководством проходят научные семинары на экономическим факультете СПбГМТУ и выступления членов секции.

В 1992 г. профессор М. Ю. Алехин создал аудиторскую фирму НКП «НЕВА-АУДИТ» и успешно ее возглавляет до настоящего времени.

Награжден высокой правительственной наградой — орденом « Дружбы» в  2006  г.; Морское Собрание Санкт-Петербурга наградило М. Ю. Алехина серебряной медалью им. акад. А. Н. Крылова (2014).

Секция «Экономика и управление» была организована в составе Центрального правления Всесоюзного научно-технического общества судостроения им. акад. А. Н. Крылова в 1970 г. Инициаторами создания секции тогда выступили кафедра экономики Ленинградского ордена Ленина кораблестроительного институт в лице заведующего кафедрой профессора д. э. н. С. П. Логинова и представители Центрального научно-исследовательского института «Румб» (ЦНИИ «Румб»).

Основная цель создания секции заключалась в обмене передовым практическим и научным опытом организации производства и труда на судостроительных предприятиях, оценки эффективности производственно-хозяйственной деятельности предприятий отрасли и установления цен на суда и корабли.

С 1970 по 1994 г. секция активно проводила семинары и научные конференции по наиболее актуальным вопросам экономики и организации производства. В разные годы секцией руководили известные ученые и экономисты отрасли, в том числе профессора С. П. Логинов, Р. М. Петухов, Л. Б. Бреслав, к. э. н. Б. М. Пукшанский.

Секция издавала ежегодные сборники научных докладов и статей ведущих и молодых экономистов отрасли.

В 2005 г. руководителем секции был избран профессор М. Ю. Алехин.

В настоящее время секция осуществляет свою работу по следующим актуальным направлениям экономики:

— внедрение современных методов управления промышленным предприятием,

— налогообложение и налоговое планирование,

— внедрение системы «бережливого производства» в судостроении,

— современные методы экономического и финансового анализа,

— современные методы экономической эффективности инвестиций,

— инновации и их применении в судостроении

— особенности функционирования малых предприятий в судостроении,

— финансовые аспекты деятельности судостроительных предприятий и др.

С 2006 г. в связи с образованием на экономическом факультете СПбГМТУ кафедры «Бухгалтерский учет, анализ и аудит» на семинарах стали активно освещаться вопросы учета, анализа и аудита на предприятиях и в организациях отрасли.

В процессе своей работы секция и ее члены ведут активную работу по подготовке и  повышению квалификации студентов, магистров и аспирантов экономического факультете СПбГМТУ. Секция является рабочей площадкой для подготовки высококвалифицированных научных кадров для судостроения.

С 2013 г. в рамках секции проводится ежегодная научно-практическая конференция «Актуальные вопросы учета, анализа и аудита». Инициатором и руководителем конференции является заведующая кафедрой «Бухгалтерский учет, анализ и аудит» кандидат экономических наук, доцент Е. А. Наумова. Секция планирует организовать международную научно-практическую конференцию «Актуальные вопросы экономики, учета, анализа и аудита» в мае-июне 2016 г.