Родился 1 февраля 1956 г. в Ленинграде. После окончания в 1979 г. кораблестроительного факультета Ленинградского кораблестроительного института был направлен на работу в Ленинградское проектномонтажное бюро «Рубин» (ныне АО «ЦКБ МТ «Рубин»).

Пройдя в организации по всем ступеням конструкторских должностей — от инженера-конструктора до начальника отдела, стал главным конструктором по специализации — начальником отделения
корпусных конструкций и судовых устройств (2005). Принимал участие в создании подводных лодок II, III, IV поколений. Под его непосредственным руководством реализован ряд новаторских конструктивных решений, примененных впервые в отечественной практике
при создании прочного корпуса и основных корпусных подводных
лодок, техники гражданского назначения: ледостойких морских платформ для добычи нефти и газа, сооружений комплекса защиты Санкт-Петербурга от наводнений.

Был назначен заместителем генерального директора — главным инженером (2007) и первым заместителем генерального директора — главным инженером (2010). Избран генеральным директором АО «ЦКБ МТ «Рубин» решением годового общего собрания акционеров от 29 июня 2012 г.

Доктор технических наук, член-корреспондент Академии инженерных наук им. А. М. Прохорова. Производственные и научные заслуги
И. В. Вильнита отмечены присвоением звания «Заслуженный конструктор РФ» (2001), присуждением премии Правительства РФ в области науки и техники (2002) .